Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms