Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift43Q9DA69 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms