Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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