Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D979 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D979 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D979 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D979 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D979 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D979 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D979 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D979 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D979 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D979 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms