Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms