Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms