Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifrd2Q9D8U0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms