Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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