Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lin37Q9D8N6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin37Q9D8N6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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