Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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