Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms