Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms