Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capns2Q9D7J7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms