Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms