Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a3Q9D554 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms