Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc130Q9D516 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms