Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms