Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms