Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms