Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms