Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms