Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms