Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms