Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms