Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc8bQ9D2D9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc8bQ9D2D9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms