Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms