Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms