Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R2

Kti12, Protein KTI12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kti12Q9D1R2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kti12Q9D1R2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kti12Q9D1R2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms