Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf4Q9D1H6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf4Q9D1H6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms