Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms