Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms