Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem88Q9D0N8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem88Q9D0N8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem88Q9D0N8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms