Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms