Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms