Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms