Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis18aQ9CZJ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis18aQ9CZJ6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms