Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prelid3bQ9CYY7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms