Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChtopQ9CY57 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChtopQ9CY57 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms