Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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