Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mis12Q9CY25 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms