Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms