Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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