Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm5Q9CXE0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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