Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms