Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wdr55Q9CX97 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wdr55Q9CX97 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms