Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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