Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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