Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms