Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx10Q9CWT3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx10Q9CWT3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms