Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms